草薢含有薯蓣皂甙等多种甾体皂甙。石菖蒲含有细辛醚,氨基酸和糖类。乌药含有生物碱及挥发油。益智仁含有萜烯、倍半萜烯、倍半萜烯醇等挥发油成分。本方具有较强的降温与止痛功能。可抑制金黄色葡萄球菌、甲型溶血性链球菌、伤寒及大肠杆菌、绿脓杆菌而抗菌。方中石菖蒲对絮状表皮癣菌、堇色毛癣菌、白色念珠菌等10余种真菌也有较强的抑制作用。且可缩短血浆再钙化时间,促进血凝而有良好的止血功效。
萆薢分清丸以萆薢为君药,味苦性平,归肾、胃经,善泄阳明、厥阴湿热,去浊而分清;臣以益智仁,暖肾缩便,补脾益气,君臣相配,温肾而利湿,固本而清源;石菖蒲为佐,宣气逐湿,辟秽开窍,以助祛邪化湿之功;使以乌药,归肾、膀胱经,既能温肾散寒,行气止痛,又可将他药引入病灶。诸药相配,共奏温肾健脾、分清祛浊功效。现代药理研究证实本方具有良好抗菌、消炎、利尿、通淋的作用,对各种急慢性泌尿系统疾病均有显著疗效。
同时,萆薢可减轻实验性动脉粥样硬化,可扩张血管使血压下降,增高血糖,合乌药可增加肠道平滑肌的蠕动。并扩张局部血管使血循环加速。故可用于乳糜尿、慢性前列腺炎、肾炎、肾结核合并血尿、慢性附件炎等疾病。此外,石菖蒲能镇静抗惊厥,并能增强戊巴比妥钠的催眠作用。临床以单味石菖蒲治疗各种原因引起的癫痫大发作数量较多,总有效率较高。